1、肌腱病、肌腱断裂 氟喹诺酮类药物，包括盐酸莫西沙星，会使所有年龄段患者的肌键炎和肌腱断裂的风险增加这种最常见的不良反应包括跟腱，跟腱破裂，可能需要手术修复。在肩，手部，肱二头肌，拇指和其他肌腱点出现肌腱炎和肌腱断裂也有报道。这种风险在60岁以上老年患者，服用皮质类固醇药物患者及肾脏、心脏或肺移植手术的患者进一步增加。除了年龄和使用皮质类固醇的因素外，另可独立地增加肌腱断裂的风险的因素包括剧烈的体力活动，肾功能衰竭，和以前的肌腱疾病，如类风湿关节炎。肌腱炎和肌腱断裂也发生在没有上述风险因素的服用氟喹诺酮类药物的患者中。肌腱断裂可发生在治疗过程中或治疗结束后；在治疗结束数月后发生肌腱断裂亦有报道。在病人发生疼痛，肿胀，炎症或肌腱断裂后，应停止应用本品。 在出现肌腱炎或肌腱断裂的迹象后，应建议患者休息，并与医师联系，换用非喹诺酮类抗生素药物。
2、重症肌无力加重 氟喹诺酮类药物，包括盐酸莫西沙星，有神经肌肉阻断活性，可能加剧重症肌无力患者的肌无力症状。上市后的严重不良事件，包括死亡和需要通气支持，和患有重症肌无力患者使用喹诺酮药物相关。避免毒有重症肌无力的患者使用盐酸莫西沙星。
3、QT间期延长 盐酸莫西沙星已被证明可使某些病人的心电图OT间期延长。口服0.4g的盐酸莫西沙星：从给药前至盐酸莫西沙星达最大浓度时，平均OTc变化为6msec。静脉滴注0.4g的盐酸莫西沙星（每天静滴时间为1小时），从给药前至给药第1天时，平均QTc变化为10mscc，第3天平均OTc变化为7msec。 由于缺乏这些病人的用药经验，该药物应避免用于己知QT间期延长的患者，低钾血症患者和接受抗心律失常lA类药物（例如，奎尼丁、普鲁卡因胺）或Ⅲ类药物（例如，胶碘酮、索他洛尔）的患者。尚未进行盐酸莫西沙星和其他延长OT间期的药物，如西沙必利、红霉素、抗精神病药物和三环抗抑郁药的药代动力学研究，不能排除盐酸莫西沙星和这些药物具有叠加效果。因此，同时给予莫西沙星和这些药物时应谨慎。 在上市前临床试验中，心血管不良事件的发生率在798个使用盐酸莫西沙星的患者和同时接受已知可致OT间期延长药物的对照患者中是相似的。 对具有心律失常或可能导致心律失常的患者应谨慎使用盐酸莫西沙星，如心动过缓、急性心肌缺血。 QT间期延长的程度会随着药物浓度或者静脉制剂的输液速率的增加而增加，因此，不应超过推荐剂量或输注速度。QT间期延长可能导致室性心律失常的风险增加，包括尖端扭转。在盐酸莫西沙星超过15，500例的对照临床研究中，包括759例在治疗开始时为低血钾的患者，没有由于OT间期延长导致的心血管疾病发病率或死亡率的增加。在1个超过18，000例盐酸莫西沙星片剂治疗的患者参加的上市后观察性研究中，没有观察到死亡率的增加，这些患者未进行心电图的检测。老年患者使用盐酸莫西沙星可能会更容易引起药物相关的QT间期延长。此外，在轻度、中度或重度肝硬化的患者使用盐酸莫西沙星应谨慎。
4、过敏反应 接受喹诺酮类药物治疗的患者，包括盐酸莫西沙星，已报道发生严重的过敏。一些患者在第一次给药后即发生，有些反应可伴随有心血管系统衰竭、丧失意识、刺痛、咽、面部水肿、呼吸困难、荐麻疹、瘙痒等。严重的过敏反应需要肾上腺素紧急治疗。莫西沙星应在第一次出现皮疹或其他任何过敏迹象时停止应用。必要时可进行输氧，静脉注射类固醇，气道管理，包括插管等措施。
5、其他严重并且有时致命的反应。 在接受喹诺酮类药物，包括盐酸莫西沙星治疗的患者，已有出现其他严重、有时是致命的事件的报道。这些事件中有些是由于过敏，有些则病因不明。这些事件可能是严重的，通常发生在多剂量给药后。临床表现可包括以下的一个或多个症状： 发热、皮疹、严重的皮肤反应（例如中毒性表皮坏、史蒂文斯约翰逊综合征） 血管炎；关节痛：肌痛：血清病： 过敏性肺炎： 急性间质性肾炎； 急性肾功能不全或衰竭； 肝炎、黄痕，急性肝坏死或衰竭： 贫血、血小板减少症、溶血性贫血和再生障碍性贫血等，包括血栓性血小板减少性紫薇、白细胞减少症、粒细胞缺乏症、全血细胞减少症，和/或其他血液系统异常； 药物应在第一次出现皮疹、黄疽或任何其他过敏表现时立即停止并且采取措施。
6、中枢神经系统的影响 氟喹诺酮类药物，包括盐酸莫西沙星，可能导致中枢神经（中枢神经系统）的事件，包括：紧张、激动、失眠、焦虑、恶梦或偏执狂。 患者接受氟喹诺酮类药物发生惊厥已被报道。氟喹诺酮类药物也可能导致中枢神经（中枢神经系统）的事件包括：头晕、错乱、震颤、幻觉、抑郁和很少的自杀念头或行为。这些反应可能发生在首次用药后。如果这些反应发生在患者接受盐酸莫西沙星时，应停止给药并采取适当的措施。如同所有的氟喹诺酮类，盐酸莫西沙星对已知或怀疑有中枢神经系统疾病的患者（例如，严重的脑动脉硬化、震病）或存在其他风险因素的患者（如有发作倾向或发作阀值降低）应谨慎使用。
7、艰难梭菌相关性腹泻 几乎所有的抗菌剂均出现过艰难梭菌相关性腹泻（CDAD）的报告，包括盐酸莫西沙星，严重程度从轻度腹泻至严重结肠炎。抗菌剂治疗，使结肠的正常菌群改变，从而导致艰难梭菌过度生长。 艰难梭菌产生的毒素A和B，是艰难枚菌相关性腹泻的原因。高毒性的梭菌引起的发病率和死亡率均升高，这些感染抗菌治疗无效，并可能需要结肠切除术。在接收抗生素治疗后，出现腹泻均应考虑CDAD的可能性。因为CDAD可能发生在应用抗菌药物治疗后两个月，因此仔细的病史询问是必要的。如果怀疑或证实艰难梭菌相关性腹泻，目前使用的不针对艰难梭菌的抗生素可能需要停止。应适当补充液体和电解质，补充蛋白质，应用针对艰难梭菌的抗生素治疗，出现临床指征时应进行手术评价。
8、周围神经病变 已有报道患者接受氟喹诺酮类包括盐酸莫西沙星产生罕见的感觉或感觉运动性轴索神经病，影响小和 /或大的轴索，致皮肤感觉异常、感觉迟钝、触物痛感和衰弱。症状可能在盐酸莫西沙星用药后很快发生并且可能是不可逆的。如果患者出现外周神经病变症状包括疼痛、烧灼感、麻刺感、麻木和/或无力，或其它感觉包括轻触觉、痛觉、温觉、位置觉和振动觉的变化，应立即停止盐酸莫西沙星用药。
9、动物的关节病 口服盐酸莫西沙星引起未成熟犬玻行。负重关节的组织病理学检查发现这些狗软骨永久性改变。相关嘘诺酮类药物也产生负重关节的软骨糜烂，以及在未成熟的各种动物物种产生其他关节症状。
10、对血糖的干扰 和所有氟喹诺酮类药物一样，使用莫西沙星有报道血糖受到干扰，包括高血糖和低血糖。在使用莫西沙星的患者中，血糖障碍主要发生于那些同时口服降糖药（如磺酰脲类药物）或使用胰岛素的老年患者中。 对于糖尿病患者，需更加注意监测血糖。如发生低血糖，需立即停用莫西沙星并开展适当治疗。
11、光敏性/光毒性 在应用喹诺酮类抗生素后暴露于阳光或紫外线照射下，会发生中度至严重的光敏性/光毒性反应，后者可能表现过度的晒伤反应（例如，烧灼感、红斑、水泡、渗出、水肿），常在暴露于光的部位出现（通常是脖子的“V”型区域、前臂伸肌表面、手的背部）。因此，应该避免过度暴露于光源下。发生光毒性反应时应停用药物。
12、细菌耐药性的发生 在没有证据或强烈怀疑细菌感染的情况下，或者缺乏预防性应用指征的情况下，使用盐酸莫西沙星并不能使患者受益，反而会增加细菌耐药性的发生。
13、对驾驶或操作机械能力的影响 没有进行有关莫西沙星对驾驶和操作机械能力的影响方面的试验。然而，包括莫西沙星在内的氟喹诺酮类药物可能会导致患者出现中枢神经系统反应（如头晕，急性、短暂的目盲，参见【不食反应】）或急性和短时间的意识丧失（晕厥，参见【不良反应】），会损害患者的驾驶或操作机械的能力。应当建议患者在驾驶或操作机械之前考虑自己对莫西沙星是否有反应。
